سونر چاغاپتاي هو زميل "بايير فاميلي" ومدير "برنامج الأبحاث التركية" في "معهد واشنطن". كتب الكثير من المؤلفات حول العلاقات الأمريكية التركية والسياسة المحلية التركية والقومية التركية، وله منشورات في المجلات العلمية ووسائل الإعلام المطبوعة الدولية الرئيسية، بما في ذلك مجلات وصحف مثل "وول ستريت جورنال" Wall Street Journalو"واشنطن بوست" Washington Postو"نيويورك تايمز" New York Timesو"فورين أفيرز" Foreign Affairsو"ذي أتلانتيك" The Atlantic. هو صاحب عمود منتظم في صحيفة "حرييت ديلي نيوز" Hürriyet Daily News، الصحيفة الصادرة باللغة الإنجليزية الأقدم والأكثر تأثيرًا في تركيا، كما يساهم في مدونة "غلوبال بابليك سكوير" Global Public Squareالتابعة لـ"سي أن أن". يظهر بشكلٍ منتظم على قنوات "فوكس نيوز" Fox News و"سي أن أن" CNN و"أن بي آر" NPR و"بي بي سي" BBC و"سي أن أن تورك" CNN-Turk. نُشر كتابه الأخير بعنوان "سلطان في الخريف: أردوغان يواجه قوى لا يمكن احتواؤها في تركيا" في حزيران/يونيو 2021 من قِبل دار نشر "آي بي توريس" وتُرجمت كتبه إلى اللغات التركية والإيطالية واليونانية والرومانية والكرواتية.
درس الدكتور چاغاپتاي التاريخ وكتب أطروحة الدكتوراه عن القومية التركية وحاز على الشهادة من "جامعة يال" عام 2003. درّس عددًا من المقررات في "جامعة يال" و"جامعة برينستون" و"جامعة جورجتاون" و"كلية سميث لشؤون الشرق الأوسط والمتوسط وأوروبا الشرقية"، أما المقرر الذي درّسه في ربيع عام 2003 عن تاريخ تركيا الحديث فكان الأول من نوعه في هذا المجال في "جامعة يال" منذ ثلاثة عقود. شغل بين عامَي 2006 و2007 منصب أستاذ جامعي ضمن برنامج "إرتيغون" في قسم دراسات الشرق الأدنى في "جامعة برينستون".
حصل د. چاغاپتاي على الكثير من المناصب الشرفية والمنح والمناصب الرئاسية، ومنها برامج "سميث ريتشاردسون" و"ميلون" و"رايس" و"ليلان" للزمالة، فضلًا عن رئاسة برنامج "إرتيغون" في "جامعة برينستون". عمل أيضًا بالتعاقد كرئيس "برنامج الدراسات المتقدمة حول تركيا" في "معهد الخدمة الخارجية" التابع لوزارة الخارجية الأمريكية. وفي عام 2012، تمت تسميته "قائدًا شابًا للمجتمع الأمريكي التركي".
أصبح الدكتور چاغاپتاي مدرّب يوغا مسجّلًا من فئة RYT-200 في عام 2018، بعد تلقيه التدريب في الهند.